版本如何編號
版本號碼決定格線的大小。每邊的模組數是 17 加上 4 倍的版本號碼，所以版本 1 是 21 × 21，版本 2 是 25 × 25，版本 40 是 177 × 177。
版本說的是模組數量，而不是實際尺寸。版本 2 的 QR Code 可以印得像廣告看板一樣大，也可以小得像一張郵票；版本改變的是能容納多少資料，以及模組有多細。
- 版本 1：21 × 21 個模組
- 版本 2：25 × 25 個模組
- 版本 10：57 × 57 個模組
- 版本 25：117 × 117 個模組
- 版本 40：177 × 177 個模組
- Micro QR M1 到 M4：11 × 11 到 17 × 17 個模組
版本如何選定
大多數產生器會在所選的錯誤更正等級下，挑選能容納資料的最小版本。內容較長、編碼模式效率較差，或錯誤更正等級較高，都會讓 QR Code 進入更大的版本。
版本越高，在相同的印刷尺寸下模組越多也越小，所以需要更清晰的印刷，以及更近的距離或更好的相機。讓內容保持簡短，例如使用短網址，就能讓版本維持在低位，QR Code 也容易掃描。
隨版本而變的結構
版本也決定了哪些固定圖案會出現。版本 1 沒有對位圖案，版本 2 以上有一個或多個，版本 7 以上則在兩個定位圖案旁邊帶有版本資訊區塊。